Baptiste Guillaume maakte zijn profdebuut bij RC Lens in een wedstrijd in Clermont-Ferrand, die met 1-0 werd verloren. In de daaropvolgende duels werd hij geregeld vervangen door Eric Sikora. Zijn eerste profdoelpunt maakte hij tegen Nîmes in het stadion Bollaert, opnieuw in een verloren wedstrijd: 1-2. Aan het einde van het seizoen namen Gervais Martel en Hafiz Mammadov de club over, waarna Antoine Kombouaré de ontslagen trainer verving en Guillaume bij de beloftenploeg werd ingedeeld.
In het seizoen 2014-2015 keerde de club uit Artesië terug naar de Ligue 1, maar financiële problemen en een transferverbod dwongen de coach om jonge spelers zoals Guillaume in te zetten. Hij kreeg zijn eerste basisplaats in een uitwedstrijd tegen Toulouse FC, gewonnen met 0-2, en scoorde zijn eerste doelpunt in de Ligue 1 tegen Olympique Marseille in het Stade Vélodrome, in een nederlaag met 2-1. Op 22 januari 2015 kondigde Antoine Kombouaré zijn vertrek naar LOSC Lille aan. Daar tekende Guillaume een contract voor vijf jaar, voor een transfersom van meer dan vier miljoen euro. Zijn eerste wedstrijd voor LOSC speelde hij op 21 februari tegen AS Monaco, die eindigde op 0-0. Door een doelpuntloze eerste seizoenshelft verdween hij geleidelijk uit de ploeg. Later werd hij voor het seizoen 2016-2017 uitgeleend aan Racing Club de Strasbourg Alsace, waar hij in de tweede seizoenshelft uitgroeide tot een van de belangrijkste aanvallende krachten met zeven doelpunten en vijf assists.
- Hoe verliep het professionele debuut van Baptiste Guillaume en wanneer maakte hij zijn eerste doelpunt?
- Hoe verliep de periode van Baptiste Guillaume toen de club terugkeerde naar de Ligue 1?
- Hoe verliep de overgang van Baptiste Guillaume naar Lille OSC en zijn latere uitleenbeurt aan Racing Club de Strasbourg Alsace?
- Hoe verliep de clubcarrière van Baptiste Guillaume na zijn promotie met de Elzassische club?
Professioneel debuut en eerste doelpunt
Baptiste Guillaume maakte zijn professionele debuut in een wedstrijd in Clermont-Ferrand, die eindigde op een 1-0-nederlaag. In de daaropvolgende wedstrijden werd hij meerdere keren vervangen door Eric Sikora. Zijn eerste professionele doelpunt scoorde hij tegen Nîmes in het Stade Bollaert-Delelis, maar ook die wedstrijd ging verloren, met 1-2.
Terugkeer naar de reservespelersploeg
Aan het einde van het seizoen namen Gervais Martel en Hafiz Mammadov de club over waar Baptiste Guillaume speelde. Vervolgens werd Antoine Kombouaré aangesteld als vervanger van de ontslagen trainer, waarna Guillaume naar de reservespelersploeg werd doorgeschoven. In het seizoen 2014-2015 keerde de Artesische club terug naar de Ligue 1. Door financiële moeilijkheden en een verbod op transfers moest de Kanakse coach jonge spelers gebruiken, onder wie Baptiste Guillaume.
Verhuizing naar Rijsel en uitleenbeurt aan Straatsburg
Na zijn eerste basisplaats tijdens een uitwedstrijd tegen Toulouse FC, die eindigde in een 0-2-zege, maakte Baptiste Guillaume ook zijn eerste doelpunt in de Ligue 1 tegen Olympique de Marseille in het Stade Vélodrome, in een 2-1-nederlaag. Op 22 januari 2015 kondigde Antoine Kombouaré zijn vertrek naar Lille OSC aan. Guillaume ondertekende er een contract voor vijf seizoenen, in een transfer die op meer dan vier miljoen euro werd geraamd.
Zijn eerste wedstrijd voor Lille OSC speelde hij op 21 februari tegen AS Monaco; die wedstrijd eindigde op 0-0. In de eerste seizoenshelft kwam hij niet tot scoren, waardoor zijn speeltijd afnam. Met de komst van Frédéric Antonetti tijdens de winterse transferperiode verdween Guillaume uit de ploeg.
Voor het seizoen 2016-2017 werd hij uitgeleend aan Racing Club de Strasbourg Alsace. Hij begon het seizoen met een wedstrijd tegen Bourg-Péronnas, die op 0-0 eindigde. In de daaropvolgende thuiswedstrijd tegen Amiens werd hij na een uur vervangen, waarna Straatsburg met 1-0 won. Daarna bleef hij zes wedstrijden op rij buiten de selectie.
Van Angers tot Nîmes en Valenciennes
Baptiste Guillaume werd in de tweede helft van het seizoen een van de belangrijkste aanvallende troeven van de Elzassische club, met zeven doelpunten en vijf assists. Hij werd ook uitgeroepen tot beste speler van de Ligue 2 van de maand en leverde een bijdrage aan de promotie van de club, die aan het einde van het seizoen kampioen werd van de tweede klasse.
Daarna tekende hij een contract voor vier jaar bij Angers SCO. In zijn openingswedstrijd van het kampioenschap tegen Girondins de Bordeaux scoorde hij één keer en gaf hij een assist in een 2-2-gelijkspel, maar door de concurrentie van Karl Toko-Ekambi slaagde hij er niet in om zich als vaste titularis op te werken. Vervolgens werd hij voor één seizoen uitgeleend aan Nîmes Olympique. Daar maakte hij zijn eerste speelminuten tegen Olympique de Marseille, toen hij Umut Bozok verving, en hij scoorde zijn eerste doelpunt voor Nîmes tegen Bordeaux in het Matmut Atlantique in een 3-3-gelijkspel. Tijdens die uitleenperiode kwam hij 26 keer in actie en maakte hij twee doelpunten, naast één assist.
Na een nieuwe uitleenbeurt aan Valenciennes Football Club scoorde hij het enige doelpunt van de wedstrijd tegen Rodez AF. Na die uitleenperiode tekende hij een definitief contract voor drie jaar bij Valenciennes. Na het seizoen 2021-2022 werd hij daar vrijgelaten en tekende hij een contract voor twee jaar, met optie voor een derde jaar, bij En Avant Guingamp. Na het seizoen 2023-2024 verliet hij Guingamp en verhuisde hij naar Almere City in Nederland, waar hij een contract voor twee jaar met optie voor een extra jaar ondertekende. Later verliet hij Almere City en tekende hij bij Mans FC.